В архиве со скриптами находится 5 файлов.
При обновлении нужно у себя заменять только 3 отмеченных.
Так же нужно открыть файл quad_settings.php и сравнить его со своим файлом. Добавить себе отсутствующие строки которые идут до тега //opencart
Quad.Wiki
Manage space
Manage content
Integrations